竇性心動過速的治療主要是祛除誘因，如止痛、控制感染，糾正貧血、改善心功能、控制甲狀腺功能亢進等，必要時可適當予以β受體阻滯劑治療。但須注意，竇性心動過速多為生理應激反應所致，故在誘因未祛除情況下β受體阻滯劑勿大量應用，以防止因此產生的心臟過度抑制。
竇性心動過緩如心率在40次/分以上可觀察，嚴重竇性心動過緩者，如經治療無效或不能改善者，需安裝起搏器，防止發生心功能不全。
病態竇房結綜合征預后與病因及病變嚴重程度密切相關，因病毒性心肌炎所致病竇者，若治療積極及時，部分可獲痊愈。對長期不愈且竇房結病變不嚴重者，早期可無癥狀，但有可能發生心功能不全。病變嚴重者可發生心臟停搏或猝死，應及時安裝人工起搏器。