真核生物的RNA被翻譯之前需要通過核孔輸出,因此核輸出對基因表達有著顯著影響。所有進出細胞核的mRNA的運輸都是通過核孔進行的,受到各種輸入蛋白和輸出蛋白的控制。
攜帶遺傳密碼的mRNA需要存活足夠長的時間才能被翻譯,因為mRNA在翻譯之前必須經過很長距離的運輸。在典型的細胞中,RNA分子僅在特異性保護的條件下才是穩定的,不被RNA酶降解。 RNA降解對真核細胞基因表達調控特別重要。在真核生物中,RNA通過某些轉錄后修飾,特別是5端戴帽和3端多腺苷酸化而獲得穩定。