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  • 發布時間:2019-09-13 14:52 原文鏈接: 固相pH梯度等電聚焦實驗

    • 制膠

    • 等電聚焦

    • pH 梯度的測定

    • 檢測

               

    實驗方法原理 固相 pH 梯度凝膠是由固相 pH 梯度介質(丙烯酰胺衍生物)共價結合到聚丙烯酰胺凝膠中并形成 pH 梯度,所以制膠過程比載體兩性電解質凝膠復雜。灌膠的方法與常規聚丙烯酰胺梯度凝膠和 SDS 梯度凝膠相似。高質量的凝膠介質和固相 pH 梯度介質,聚合過程以及漂洗對固相 pH 梯度凝膠是非常重要的。
    試劑、試劑盒

    丙烯酰胺單體貯液 過硫酸銨貯液

    儀器、耗材

    灌膠模具

    實驗步驟

    1. 選擇 pH 范圍,計算緩沖與滴定 Immobiline 的體積

    對未知樣品 pH 范圍的選擇,最好先用寬范圍(如 pH 3.5~10 ) 載體兩性電解質等電聚焦確定其等電點的位置,再選擇窄范圍的固相 pH 梯度等電聚焦。確定范圍后,根據表 7.4 和 7.5 査得或進一步用內插法計算得到緩沖和滴定 Immobiline 的體積。







    2. 貯液配置

    丙烯酰胺單體貯液:溶解 14.55 g 丙烯酰胺和 0.45 g N,N'-甲叉雙丙烯酰胺在 35 ml 雙蒸水中,攪拌直至溶解,用雙蒸水加至 50 ml。過濾,溶液可在 4℃ 保存兩周。

    40% (W/V) 過硫酸銨貯液:溶解 0.4 g 過硫酸銨在 1 ml 雙蒸水中。溶液必須新鮮配置。

    Immobiline II:使用前將貯存在 4~8℃ 冰箱中的 Immobiline II 溶液在室溫平衡約 0.5 小時。

    3. 模具組裝和凝膠溶液的配置

    如 “水平平板電泳的制膠” 組裝灌膠模具,但不需要在模具上做加樣孔。如欲灌注 T=5%、C=3% 的凝膠,參見表 7.4,表 7.5 和表 7.6。凝膠溶液必須新鮮配置。一般將酸性 Immobiline 作為重液,堿性 Immobiline 作為輕液,俗稱 “酸重堿輕”。如欲提高電泳速度,可加 100 μl 載體兩性電解質。



    4. 灌膠

    固相 pH 梯度的灌膠模具可使用與常規聚丙烯酰胺梯度凝膠和 SDS 梯度凝膠灌膠相同的模具,參見 “水平平板電泳的制膠” 。但不需要做加樣孔,并且不需要有濃縮膠和分離膠之別。作者實驗室曾灌注 pH 4.4~5.4 固相 pH 梯度膠用于分析 Gc 蛋白亞型和 pH 5.05~5.60 固相 pH 梯度凝膠用于分析轉鐵蛋白。

    (1) 灌膠前梯度混合器的腔間閥和流出管的夾子都應關閉。

    (2) 將 7.5 ml ( 視凝膠大小而定)輕液(堿性)注入梯度混合器的儲液腔。小心打開腔間閥,趕去腔間氣泡,再關上腔間閥。若不慎有輕液流入混合腔,則需將輕液吸回儲液腔。

    (3) 將同樣體積的重液(酸性)注入梯度混合器的混合腔。在兩個腔中分別放入同樣大小的攪拌子,在儲液腔中放入補償棒,此時兩腔液面應該相平。

    (4) 將梯度混合器置于磁力攪拌器的最佳位置上。將流出管插入灌膠模具中央。為了控制流速,得到線性梯度,梯度混合器的出口與流出管末端高度相差約 5 cm。開動磁力攪拌器(200~500 r/min)。

    (5) 在兩個腔中各自先加 TEMED,再加過硫酸銨。打開流出管的夾子,當酸液流到流出管的一半時,打開腔間閥。兩腔中液面同時下降,在混合腔混合后,緩緩注入垂直放置的模具中。

    (6) 灌注完畢后,在室溫靜置 5~20 分鐘(可用異丙醇封膠 )。放入 30~40℃ 烘箱中聚合。灌膠后,立即洗凈梯度混合器,以免堵塞腔間閥。

    5. 洗膠和吹膠

    凝膠聚合約需 1 小時,從烘箱中取出凝膠模具后,同 “薄層分析等電聚焦的方法” 方法取出凝膠,標上正、負極。稱重后放入雙蒸水中(6X10 分鐘或 3X1 小時 ),室溫下振搖約 60 次/分鐘,洗去催化劑和未聚合的單體。洗膠后,用軟紙吸去表面的水。用冷風(小電扇)在一定距離約(50 cm ) 吹膠至與洗膠前重量相差小于 1%。如果凝膠中含有過多水,影響膠濃度和梯度,在電泳時易在凝膠表面形成水滴,改變導電性干擾聚焦。小于 pH 8 的凝膠至多可保存一周,堿性膠不宜保存。




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