常用免疫熒光試驗等直接檢查咽部脫落上皮細胞內的RSV抗原，以及RT-PCR檢測病毒核酸等進行輔助診斷。
因RSV所致疾病在臨床上與其他病毒或細菌所致類似疾病難以區別，故進行病毒分離和抗體檢測是必要的，即使操作復雜、費時。
近年來利用鼻咽分泌物脫落細胞及血清中IgM抗體的間接法免疫熒光技術，ELISA，堿性磷酸酶抗堿性磷酸酶橋聯酶標法（APAAP），生物素抗生物素ELISA法，辣根過氧化物酶—抗辣根過氧化物酶法（PAP）、單克隆抗體熒光法等都能進行合胞病毒感染的快速診斷。
