受體酪氨酸激酶（RTK）途徑受各種正反饋回路的嚴格調節。 因為RTK協調多種細胞功能，例如細胞增殖和分化，所以必須對它們進行調節以防止細胞功能發生嚴重異常，例如癌癥和纖維化。
蛋白酪氨酸磷酸酶
蛋白質酪氨酸磷酸酶（PTP）是一組具有磷酸酪氨酸特異性磷酸水解酶活性的催化結構域的酶。PTP能夠以正向和負向改變受體酪氨酸激酶的活性。PTP可以使RTK上活化的磷酸化酪氨酸殘基去磷酸化，這實際上導致信號終止。 有關PTP1B（一種廣為人知的參與細胞周期和細胞因子受體信號調節的PTP）的研究表明，它可以使表皮生長因子受體 和胰島素受體去磷酸化。另一方面，一些PTP是在細胞信號增殖中起積極作用的細胞表面受體。細胞表面糖蛋白Cd45在抗原刺激的特異性磷酸酪氨酸的去磷酸化中發揮關鍵作用，而這抑制Src途徑。
赫斯達汀
赫斯達汀（Herstatin）是ErbB家族的自抑制劑，它與RTK結合并阻斷受體二聚化和酪氨酸磷酸化。 用赫斯達汀轉染CHO細胞響應于EGF會導致受體寡聚化、克隆生長和受體酪氨酸磷酸化的減少。
受體胞吞作用
活化的RTK可以進行內吞作用，導致受體數量下調，最終導致信號級聯減弱。 其分子機制涉及通過網格蛋白介導的內吞作用吞噬RTK，使其在細胞內降解。