術后平均生存0.9年，成人的預后較兒童為好。隨著近年來臨床醫學和基礎研究的不斷發展，隨母細胞瘤病人的預后得到不斷改善。目前多數統計5年存活率均在30%以上，最高統計達80%。個別的可生存達十年以上。Quest認為療效的提高與術后重視對整個腦與脊髓軸進行放射治療是分不開的。Bruce認為，最近幾年來對兒童髓母細胞瘤的治療與結果有明顯的進步。他新報告的15例中僅1例死亡，且CT掃描證實無腫瘤復發的征象。髓母細胞瘤患者預后與多種因素有關。目前認為手術切除腫瘤的程度與預后密切相關。全切除可明顯改善預后，Raimondi認為部分切除和單純活檢其生存率無明顯差別。
術后放療是延長生存期的重要手段，輔助化療也有一定作用。此外患者年齡與預后也有密切關系，多數文獻指出較大年齡的兒童及成人髓母細胞瘤患者的預后較好。應注意的是復發和有轉移病例，其預后大大低于第一次治療，即使使用放療和化療，也不會獲得滿意的療效。
綜上所述，影響預后的因素是多方面的。無疑，徹底切除病灶，術后輔以足夠劑量的放療，有條件配合化療等綜合治療措施，可能會大大延長髓母細胞瘤患者的生存期和改善病人的生活質量。