睪丸炎通常由細菌和病毒引起。睪丸本身很少發生細菌性感染，由于睪丸有豐富的血液和淋巴液供應，對細菌感染的抵抗力較強。細菌性睪丸炎大多數是由于鄰近的附睪發炎引起，所以又稱為附睪—睪丸炎。常見的致病菌是葡萄球菌、鏈球菌、大腸桿菌等。病毒可以直接侵犯睪丸，最多見是流行性腮腺炎病毒，這種病原體主要侵犯兒童的腮腺。但是，這種病毒也好侵犯睪丸，所以往往在流行性腮腺炎發病后不久，出現病毒性睪丸炎。
