應與各種出疹性傳染病、病毒感染、急性淋巴結炎、類風濕病以及其它結締組織病、病毒性心肌炎、風濕炎心臟炎互相鑒別。
該病癥與猩紅熱不同之點為：①皮疹在發病后第3天才開始；②皮疹形態接近麻疹和多形紅斑；③好發年齡是嬰幼兒及較小兒童時期；④青霉素無療效。
該病癥與幼年類風濕病不同之處為：①發熱期較短，皮疹較短暫；②手足硬腫，顯示常跖潮紅；③類風濕因子陰性。
與滲出性多形紅斑不同之點為：①眼、唇、無膿性分泌物及假膜形成；②皮疹不包括水皰和結痂。
與系統性紅斑狼瘡不同之處為：①皮疹在面部不顯著；②白細胞總數及血小板一般升高；③抗核抗體陰性。④好發年齡是嬰幼兒及男孩多見。
與嬰兒型結節性多動脈類的癥狀有很多相似之處，但MCLS的發病率較多，病程產短，預后較好。這兩種病的相互關系尚待研究。
與出疹性病毒感染的不同點為：①唇潮紅、干裂、出血，呈楊梅舌；②手足硬腫，常跖潮紅及后期出現指趾端膜狀脫皮；③眼結膜無水腫或分泌物；④白細胞總數及粒細胞百分數均增高，伴核左移；⑥血沉及C反應蛋白均顯著增高。
與急性淋巴結炎不同之點為：①頸淋巴結腫大及壓痛較輕，局部皮膚及皮下組織無紅腫；②無化膿病灶。
與病毒性心肌炎不同之處為：①冠狀動脈病變突出；②特征性手足改變；③高熱持續不退。
與風濕性心臟炎不同之處為：①冠狀動脈病變突出；②無有意義的心臟雜音；③發病年齡以嬰幼兒為主。