胃十二指腸粘膜除了經常接觸高濃度胃酸外，還受到胃蛋白酶、微生物、膽鹽、乙醇、藥物和其他有害物質的侵襲。但在正常情況下，胃十二指腸粘膜能夠抵御這些侵襲因素的損害作用，維護粘膜的完整性。這是因為胃十二指腸粘膜具有一系列防御修復和修復機制，包括粘液/碳酸氫鹽屏障、粘膜屏障、粘膜血流量、細胞更新、前列腺素和表皮生長因子等。消化性潰瘍的發生是由于對胃十二指腸粘膜有損害作用的侵襲因素與粘膜自身防御－修復因素之間失去平衡作用的結果。這種平衡可能是由于侵襲因素增強，亦可能是防御－修復因素減弱，或兩者兼有之。GU和DU在發病機制上有不同之處，前者主要是防御、修復因素減弱，后者主要是侵襲因素增強。消化性潰瘍是由多種病因所致的疾病，即患者之間的病因、發病機制可能并不相同，只是臨床表現相似而已。