多數病人預后良好，經數周、數月甚至遷延數年漸痊愈。少數呈暴發起病，因心源性休克、急性心力衰竭或嚴重心律失常于數小時或數天內死亡。個別病例因嚴重心律失常猝死。有的呈遷延過程，遺留不同程度左室功能障礙，其中有的僅有超聲心動圖或心電圖改變，并無臨床癥狀，然而少數病例則因心力衰竭遷延不愈，導致死亡。預后好壞主要取決于心肌病變的嚴重程度，并與以下因素有關：
1.感染病毒的型別。
2.病人年齡，新生兒發病死亡率最高。
3.病情復發者預后差。
4.左室射血分數明顯下降者預后差。
5.并發室性心動過速者預后不良。