癥狀性嬰兒痙攣癥多數預后不良,主要表現為智力運動發育落后,驚厥難以控制或轉變為其他類型發作。痙攣性發作持續3~30個月,一般1歲后減少,3歲后痙攣發作趨于消失。約半數患兒轉變為其他類型發作,多為全身性發作,包括不典型失神、強直性發作、強直-陣攣性發作、失張力發作等,也可有部分性發作。部分嬰兒痙攣癥發展為Lennox~Gastaut綜合征。大多數患兒遺留精神運動發育落后。