嚴重感染是CGD致死的主要原因，美國的隊列研究顯示X-CGD病死率（21.2%）高于AR-CGD（8.6%）。歐洲隊列研究的結果為，X-CGD平均生存期為37.8歲，AR-CGD為49.6歲。盡早診斷、持續預防、積極治療細菌和真菌感染，可顯著改善CGD患兒的預后。
