其常見副反應為消化道癥狀，可出現食欲不振、惡心、嘔吐及腹瀉等，遇此情況應認真分析：若為藥物一般副作用可調整用藥時間，避免空腹時用藥；若為變態反應所致則應停藥。少數患者可發生黃疸及轉氨酶升高，常見于劑量過大或患有慢性肝炎者。因此，要嚴格控制用藥劑量，有肝膽疾病史的患者禁用該藥，在常規劑量下應用時亦應定期檢查肝功能。另外利福平也有導致急性腎功能衰竭和急性溶血的報道。
