（1） 用物理方法盡量去除瘤體。
（2） 應用免疫藥物：應用免疫制劑注射和外用等。
以上方法的有效組合應用，隨訪3-6個月后HPV感染引起的各類皮損可以臨床治愈。但是上述方法只適用于各類良性病變，所以HPV感染引起的病變早期發現非常重要，但是也有些HPV感染和各種疣可以自動清除，但醫生無法告知哪個患者屬于自動清除病毒和自愈的人。
（3）特殊部位感染的治療：主要指宮頸高危型HPV感染的治療
目前的科研已經表明：宮頸的高危型HPV持續性感染可以引起宮頸癌。所以如何清除宮頸的感染，及早防治宮頸癌的發生是非常重要的。現行的宮頸癌的預防的手段是早期發現癌前病變，方法有：陰道窺器肉眼觀察、宮頸刮片（TCT）、陰道鏡（必要時活檢病理）、HPV-DNA檢測等。這些方法只是查出宮頸癌前病變，以便于早期采取治療辦法。但是對于篩查發現的宮頸高危型HPV及輕度的宮頸病變，尤其是對于未生育的年輕女性，當前沒有更好的辦法以清除病毒和治愈相應的病變。
令人欣慰的是我們經過多年的科研和探索已經探索出一些經驗可以治愈宮頸的早期病變和清除病毒，在進一步的科研驗證。
