乳腺導管擴張癥的發病機制在學界尚有爭議，一般來說有以下幾種看法：
1.導管排泄障礙
如先天性乳頭畸形、凹陷、不潔或外來毛發、纖維等引起乳孔堵塞，導管發育異常，乳腺結構不良，導致上皮增生炎癥損傷等引起導管狹窄、中斷或閉塞。導管內分泌物積聚，引起導管擴張。部分中、老年婦女由于卵巢功能減退，乳腺導管呈退行性變，管壁松弛，肌上皮細胞收縮力減退，導致導管內分泌物積聚而管腔擴張引起本病。
2.異常激素刺激
有學者發現病人血中性激素水平異常，排卵前期血中雌二醇（E2）、黃體生成素（LH）水平低于正常，而泌乳素（PRL）水平高于正常。異常的性激素刺激能促使導管上皮產生異常分泌，導管明顯擴張。一般來說，單有阻塞存在而無異常激素刺激促使上皮分泌，不致發生導管擴張。導管排泄不暢，常是溢乳期發展到腫塊期的主因。
3.感染
部分學者認為該病伴有厭氧菌感染或乳暈部感染，侵及皮下，波及乳管，經乳管穿通后形成瘺管。或在導管阻塞的基礎上，管內脫落的上皮細胞和類脂分泌物大量積聚，并逸出管壁分解后產生化學物質，引起周圍組織的化學性刺激和抗原反應，引起以漿細胞為主的炎癥過程。